Alis, sono d'accordo con te; viste le modalità con cui si manifesta il problema, la causa non può dipendere da stati emozionali.

La Felv non provoca questi problemi oculari; quando essi sono presenti, non sono causati direttamente dalla Felv, ma sono una delle conseguenze dello stato di immunodeficienza che questa patologia provoca e di conseguenza il gatto è facilmente soggetto a contrarre malattie di ogni genere.

Nel tuo micio si verificano episodi di midriasi e di anisocoria, apparentemente senza motivo, che poi si risolvono spontaneamente.
Non sono un medico, ma secondo me la causa è nella testa.

Può capitare quando si subisce un trauma cranico, che si formi un ematoma che può premere sulle strutture nervose che regolano la funzionalità oculare.
Però visto che il problema alle pupille è iniziato da alcuni mesi, se si fosse trattato di un ematoma a quest'ora sarebbe già stato riassorbito, quindi tenderei ad escludere la causa traumatica.

Escluderei anche che la causa possa risiedere in un'ipotetica insufficienza renale, per il motivo che essa provoca midriasi, ma non provoca anisocoria.

Potrebbe dipendere da un problema vascolare, tipicamente un aneurisma, che si verifica quando a causa della debolezza della parete di un vaso sanguigno, generalmente un'arteria, essa si gonfia in modo anomalo nel punto in cui la parete è più debole, formando una sacca dove scorre il sangue e che va a premere sulle strutture vicine, per esempio un nervo.
Nell'ipotesi che un aneurisma comprima il nervo oculomotore, si potranno avere come conseguenze proprio quei caratteristici malfunzionamenti della pupilla.
Anche neoformazioni in sede cerebrale, sia benigne che non, possono causare problemi alle pupille.
Senza dimenticare le neuropatie diabetiche e quelle del nervo ottico, il glaucoma e tutta una serie di altre possibili cause.

Non ti so però dire se in questi ipotetici casi i disturbi oculari siano intermittenti o una volta instauratisi siano costantemente presenti.

L'ipersalivazione potrebbe dipendere dall'imminente arrivo del vomito, succede anche agli umani che subito prima di rigettare la bocca si riempia abnormemente di saliva.
Certo il fatto che vomito e diarrea giungano in concomitanza con le crisi oculari porta a pensare che questi eventi siano in correlazione, ragione di più per indagare a fondo.

Come vedi si possono fare tante ipotesi, ma per avere certezze, e la certezza è l'unica cosa che conta davvero, è indispensabile consultare gli specialisti.